注意：
（1）Windows NTは、Windows 95/98/Meとは異なり、2台目以降のハードディスクにもインストールできます。しかし、Windows NTのプログラム本体はパーティション1（Dドライブ）や2台目のハードディスクにインストールされても、起動部分（OSローダー）は通常1台目のパーティション0（Cドライブ）にインストールされます。従って、パーティション0（Cドライブ）は、Windows NTが認識できるファイルシステム（=FAT16）であることが必要です。

たとえば、FAT32でフォーマットされたWindows 95/98/MeがインストールされているパソコンにWindows NTをインストールしても、Windows NTを起動することはできません。

（2）Windows 2000もWindows NT同様、2台目以降のハードディスクにもインストールできます。起動部分（OSローダー）は、通常1台目のパーティション0（Cドライブ）にインストールされます。Windows 2000を1台目のハードディスクのパーティション1（Dドライブ）以降にインストールする場合、システムコマンダーの機能を使い、パーティション0（Cドライブ）を隠すことで、OSローダーをWindows 2000と同じパーティションにインストールすることもできます。2台目以降にインストールする場合は、この方法は使用できません

（3）Windows NTは、その起動部分が、ハードディスクの先頭から2ギガバイト以内に収まる基本FAT16にインストールされなければ起動することができません(Windows 2000にはこの制約はありません)。

（4）PCにプリインストールされているWindows NT/2000で、リカバリーディスクで供給されているものを使用すると、PCの出荷時の状態に戻ってしまうものがあります。そういったリカバリーディスクを使ってWindows NT/2000を追加インストールすることはできません。その場合は、Windows NT/2000の製品版が別途必要となります。

１． マシンを起動し、システムコマンダーの選択メニューを表示します。次に、Alt+OでOSウィザードを起動します。
２． OSウィザードのダイアログが表示されたら、キャンセルボタンをクリックし、[スタート]の[パーティション操作]を選択します。
３． パーティションのマニュアル操作の画面 が表示されますので、Windows NT/2000に必要な空き容量を作成してください。
４． Windows NT/2000のインストールディスクをフロッピードライブに入れ、システムを再起動します。Windows NT/2000のインストーラーに従って、OSをインストールします。
５． Windows 2000のインストールでは、MBR（マスターブートレコード）と呼ばれる所が更新されます。その結果 、システムコマンダーのOS選択メニューが表示されなくなり、マルチブートが出来なくなります。従って、インストールが終了したら、次のことを実行して、システムコマンダーを有効にして下さい（Windows NTの場合、この作業は必要ありません）。
６． フロッピードライブにシステムコマンダーのユーティリティディスクを挿入し、再起動します。自動的に、MBR（マスターブートレコード）が更新されます。

以上の方法で、Windowsを共存することができます。